Prvý nástrel KSG estimatora Transfer Entropy.
Parametre:
Target history embedding length=1
Target history embedding delay=1
Source history embedding length=1
Source history embedding delay=1
Delay from source to target=1
k-nearest neighbours=4
Pozorovania:
Porovnával som hodnoty TE môjho KSG algoritmu a JIDT Liziera na rovnakom datasete. Výsledky: môj=0.073745641982090104; JIDT=0.0737. Vyzerá, že celkom sedí.
Je to pomalé. Časová zložitosť je
To Do:
Zovšeobecnit estimator na ľubovoľné hodnoty parametrov.
Pozrieť sa na optimalnejšie riešenia. (KDTree?)
Použité dáta:
SFI-heartRate_breathVol_bloodOx3.txt
Zdrojáky:
TE.py